Основными направлениями деятельности Росатомфлота являются: ледокольное обеспечение крупнейших национальных арктических углеводородных проектов; ледокольная проводка судов в акватории Северного морского пути (СМП) и в замерзающие порты РФ; ледокольное обеспечение задач военно-морского флота в Арктике; техническое обслуживание и проведение ремонтных работ общесудового и специального назначения для атомного флота и внешних заказчиков; безопасное обращение с ядерными материалами и радиоактивными отходами.
В 2008 году Федеральное государственное унитарное предприятие «Атомфлот» вошло в состав Государственной корпорации по атомной энергии «Росатом» на основании Указа Президента Российской Федерации «О мерах по созданию Государственной корпорации по атомной энергии «Росатом» (№ 369 от 20 марта 2008 года).
Статус федеральной ядерной организации ранее уже присвоен восьми предприятиям Госкорпорации «Росатом».
| 
